1.负责制定良种工程建设规划和年度计划，指导良种工程建设工作；2.负责部省级良种工程项目监督管理工作；3.负责起草种畜禽管理方面法规、规章和规范性文件；4.依据《畜牧法》等法律、法规、规章及有关规范性文件，对种畜禽生产经营活动进行监督管理；5.负责管理畜禽遗传资源保护工作；6.负责管理种畜禽进出口工作；7.负责组织无公害畜产品产地认定、产品认证及认证后监管工作；8.负责法制建设、政务公开和依法行政管理工作。